巨人は5選手を指名し、支配下指名を終えた。
中大・西舘勇陽投手をドラフト1位で指名し、日本ハムと競合の末に阿部慎之助新監督が交渉権獲得の当たりくじを引き当てた。2位では社会人5年目のホンダ鈴鹿・森田駿哉投手を指名。3位は日立製作所・佐々木俊輔外野手、4位ではNTT西日本・泉口友汰内野手と野手を続けて指名。5位で日本生命・又木鉄平投手を指名し、選択終了となった。
巨人の指名選手一覧は以下の通り。
1位 中大・西舘勇陽投手
2位 ホンダ鈴鹿・森田駿哉投手
3位 日立製作所・佐々木俊輔外野手
4位 NTT西日本・泉口友汰内野手
5位 日本生命・又木鉄平投手
